色谱分析仪的工作原理是基于物质在固定相和流动相之间的分配差异或吸附差异，从而实现混合物中各组分的分离和分析。以下是详细的工作过程：

　　一、进样：

　　将待分析的样品通过进样装置(如注射器、自动进样器等)引入色谱系统。样品可以是气体、液体或固体，但在进入色谱柱之前需要转化为气态或液态，以便在流动相中传输。

　　二、流动相输送：

　　流动相是一种能够携带样品通过色谱柱的物质。在气相色谱中，流动相通常是惰性气体(如氦气、氮气等);在液相色谱中，流动相是液体(如甲醇、水等)。

　　流动相以一定的流速和压力被输送到色谱柱中，推动样品在色谱柱中移动。

　　三、分离过程：

　　色谱柱是实现分离的核心部件，内部填充有固定相(气相色谱中常用的固定相有聚硅氧烷、活性炭等;液相色谱中常用的固定相有硅胶、化学键合相等)。

　　当样品进入色谱柱后，样品中的各组分与固定相之间会发生相互作用，如吸附、分配、离子交换等。由于不同组分与固定相的相互作用程度不同，导致它们在色谱柱中的移动速度也不同。相互作用较强的组分在色谱柱中停留的时间较长，移动速度较慢;相互作用较弱的组分则移动速度较快。这样，样品中的各组分就会在色谱柱中逐渐分离。

　　四、检测：

　　经过色谱柱分离后的组分依次流出色谱柱，进入检测器。检测器能够检测到各组分的存在，并将其转化为电信号或其他可测量的信号。

　　常见的检测器有火焰离子化检测器(FID)、热导检测器(TCD)、紫外 - 可见检测器(UV-Vis)、质谱检测器(MS)等。不同的检测器对不同类型的组分具有不同的检测灵敏度和选择性。

　　五、数据处理和分析：

　　检测器输出的信号被传输到数据处理系统，数据处理系统对信号进行采集、处理和分析。

　　通过对色谱图(即检测器输出信号随时间变化的曲线)的分析，可以确定样品中各组分的保留时间、峰面积或峰高等信息。根据这些信息，可以对样品中的组分进行定性(确定样品中含有哪些组分)和定量(确定各组分的含量)分析。